Jag har hört att magnolia har svårt för att läka ihop ifall man sågar av grova grenar så om du har möjlighet så stötta upp. Du kanske kan göra en konstruktion av några långa käppar? Alternativt så kanske du kan dra den åt sidan istället? Det är inte bra om det blir skavsår i barken heller så det är nog bra med något mjukt emellan en eventuell träkäpp och binder du så se till att grenen har utrymme att växa i tjocklek.
Googlade och tydligen skall man om man är tvungen beskära magnolia under JAS månaderna; juli, augusti eller september. Solig varm dag är tydligen bäst.
Hoppas det blir bra

Förhoppningsvis svarar någon som vet mer om magnolier än mig här också ...